Эгберт был учеником Питера де Греббера. В 1646 году он присоединился к Харлемской гильдии святого Луки. Возможно, в 1666 году (или в начале 1670-х годов) он переехал в Лондон, где одно из его сатирических произведений, вероятно, вызвало раздражение английского короля Карла II. Хотя он официально зарегистрирован как умерший в Лондоне в 1704 году, Лоренс ван дер Веен назвал его в списке художников, умерших в 1702 году.
Хемскерк изображал на своих полотнах сцены из жизни крестьян, быт таверн, деревенские развлечения. Он испытал влияние художников Давида Тенирса и Адриана Брауэра, однако также рисовал пейзажи, сцены искушения святого Антония и фантастические композиции с изображениями шабаша ведьм. Его работа была связана с Лейденом и Гаагой.
